Le Directeur est nommé par dahir pour une période de quatre années renouvelables. Il dirige l’ensemble des services placés sous son autorité. Il est responsable de l’application du régime de formation au sein de l’Institut et veille au strict respect des règles de discipline.
Il est également chargé des missions suivantes:
- La conclusion des conventions de coopération et de partenariat au nom de l’Institut;
- l’élaboration du programme annuel des activités de l’Institut;
- la signature des diplômes délivrés par l’Institut;
- l’élaboration du règlement intérieur de l’Institut
Le Directeur est assisté, dans l’application du régime de formation au sein de l’Institut et de la gestion de ses affaires pédagogiques, par un Directeur Adjoint des Affaires Pédagogiques.
Le siège de l’Institut Mohammed VI de Formation des Imams Morchidines et Morchidates est établi à Rabat et est dirigé par Mr. Abdeslam Lazaar. Ce dernier fut nommé par Sa Majesté le Roi Mohammed VI le 27 mars 2015.